縄文時代の代表的物質文化（文学部所蔵）。
古墳時代形象埴輪の北限出土資料（文学部所蔵）。
日本人の成立過程を解きあかす重要な資料（医学部所蔵）。
２億4000万年前の世界最古の魚竜化石（理学部所蔵）。
日本の代表的鉱産資源である黒鉱鉱床の鉱石標本（理学部所蔵）。
沼津貝塚出土資料（重要文化財）沼津貝塚出土資料（重要文化財）
経の塚古墳出土資料（重要文化財）
アバクチ洞穴遺跡出土弥生時代幼児埋葬骨格
ウタツギョリュウ
黒鉱標本